Jin, dkk. menjejakkan kaki di lantai teratas Central Hall untuk menyelamatkan Mika. Namun, bersama Owl Eye, Mika yang dipengaruhi ikut menyerang mereka! Apakah Jin, dkk. dapat melepaskan Mika dari hipnotis dan menyelamatkannya? Lalu, akhirnya Jin bertemu kembali dengan kakaknya, Rei! Tapi, bersamaan..
Tahun 20XX, para pemilik kekuatan spesial tiba-tiba muncul di tengah umat manusia. Mereka yang disebut “Altered” itu ditahan dalam sebuah pulau penjara terpencil bernama Area D. Setengah tahun sejak konfrontasi Jin dan Rei… Seorang mata-mata menyusup ke sebuah kapal menuju Area D...
Ryo Hazama dan Mari yang merupakan mata-mata berhasil menyusup ke Hotel Arcadia. Tapi, mereka kesulitan menghadapi serangan Altered House yang bersembunyi di dalam hotel. Apa mereka dapat lolos dari situasi sulit itu? Lalu, kekuatan Ryo Hazama yang selama ini tersembunyi akhirnya meledak! &..
Demi menyelamatkan Mari, Ryo bergerak bersama Kaito, dkk. menuju distrik khusus pusat. Tapi, banyak musuh yang menghalangi jalan mereka. Jin Kazaragi yang dicari-carinya pun muncul. Lalu, apa sebenarnya misteri pulau penjara terpencil Area D dan konspirasi yang disusun Rei!? Pertarungan di pulau mis..